Izdelki

Nealkoholna maščobna bolezen jeter (NAFLD) ima širok spekter bolezenskih stanj, ki segajo od blage steatoze, za katero je značilno nenormalno zadrževanje lipidov v jetrnih celicah, do steatohepatitisa (NASH), ki kaže kopičenje maščobe, vnetje, napihnjenost in razgradnjo hepatocitov ter fibrozo.Navsezadnje lahko steatohepatitis povzroči cirozo jeter in hepatocelularni karcinom. V tej študiji smo analizirali tri različne vrste miši, A/J, C57BL/6J in PWD/PhJ, ki kažejo različne stopnje steatohepatitisa, če jim dajemo 3,5-dietoksikarbonil Dieta, ki vsebuje -1,4-dihidrokolidin (DDC).Analiza genske ekspresije RNA-Seq, analiza beljakovin in presnovno profiliranje so bili uporabljeni za identifikacijo diferencialno izraženih genov/proteinov in motenj presnovkov v vzorcih jeter miši po zdravljenju z DDC.Analiza poti je pokazala spremembo metabolizma arahidonske kisline (AA) in S-adenozilmetionina (SAMe) na drugih poteh.Da bi razumeli presnovne spremembe metabolizma arahidonske kisline v luči profilov izražanja bolezni, je bil razvit in optimiziran kinetični model te poti glede na ravni metabolitov.Kasneje je bil model uporabljen za preučevanje in silico učinkov možnih tarč zdravil za steatohepatitis. Presnovo AA/eikozanoidov smo identificirali kot zelo moteno pri miših, ki jih povzroča DDC, s kombinacijo eksperimentalnega in in silico pristopa.Naša analiza presnovne poti AA/eikozanoidov kaže, da so 5-hidroksieikosatetraenojska kislina (5-HETE), 15-hidroksieikosatetraenojska kislina (15-HETE) in prostaglandin D2 (PGD2) moteni pri miših DDC.Nadalje dokazujemo, da se dinamični model lahko uporablja za kvalitativno napoved presnovnih sprememb na podlagi transkriptomičnih podatkov v kontekstu, povezanem z boleznijo.Poleg tega je bilo ugotovljeno, da je presnova SAMe motena zaradi zdravljenja z DDC.Več genov kot tudi nekateri metaboliti tega modula kažejo razlike med A/J in C57BL/6J na eni strani ter PWD/PhJ na drugi strani.